学术报告：面向医学影像及基因测序数据分析的高性能大数据系统介绍

发布人：jbo竞博电竞官方网站 发布日期：2016-10-31

题 目：面向医学影像及基因测序数据分析的高性能大数据系统介绍 报告人：钟叶青，教授，台湾逢甲大学 时 间： 11月2日（周三） 下午4：00-5：00 地 点：南校区新数学楼416室   报告摘要： 「面向医学影像及基因测序数据分析的高性能大数据系统」是一个从健康照护角度出发，集成医学影像分析、基因测序数据分析、大数据处理、及云计算等核心技术的高性能大数据系统。此系统包含了「医疗诊断影像分析」、「皮肤光谱影像分析」、及「基因测序数据分析」三个核心大数据系统；及「医疗诊断影像分析大数据处理设备」、「健康美容皮肤管理大数据系统」、及「基因检测分析大数据系统」三个应用。这系统所研发的技术，包含医学影像设备, 新一代信息技术、生物技术、精准医疗, 大数据和云计算关键技术、及人工智能技术。符合我国公布的「十三五」未来五年重点科研领域。      本系统的先进性包含（1）能让关联式数据库和非关联式数据库融合成一个大数据库；（2）所有大数据分析算法（医疗诊断影像，皮肤光谱影像，基因测序数据），皆有GPU的加速版本；（3）提出两个领先全球的的深度学习网络，医疗诊断影像网络及光谱影像网络；（4）将光学和调断层扫描技术运用于皮肤检测；（5）集成一百多种常见的基因测序数据分析工具，并以内存计算来提升这些分析工具的数据存取及运算；（6）以可视化方式来呈现分析的结果，能够做到测序数据质量控管的工作(同时50套检体以上)，并且能够同时处理及分析200套以上的检体。      2015年8月19日国务院通过「关于促进大数据发展的行动纲要」中的「公共服务大数据工程」，即以建立医疗健康服务大数据；包含电子健康档案、电子病历数据库、建设覆盖公共卫生、医疗服务、医疗保障、药品供应、计划生育和综合管理业务的医疗健康管理和服务大数据应用体系。同时，也在「大数据关键技术及产品研发与产业化工程」；强调研究面向大资料计划的新体系和大数据分析理论，突破大数据认知与处理的技术瓶颈；面向网络、安全、金融、生物组学、健康医疗等重点需求。因此，本系统的开发符合国家政策规划的指导思想，在生物、新一代信息技术、生命健康相关技术的突破创新及相关平台设备的产业化具有重要的现实意义。   报告人简介： 钟叶青博士1961年11月06日生于台湾基隆，1992年拿到美国雪城大学（Syracuse University）计算机博士学位。毕业后回到台湾，在逢甲大学资讯工程学系任教，担任副教授，教授，系主任，及所长等职务。2002年08月至2016年01月，在台湾清华大学资讯工程学系担任教授，其间曾担任图书馆副馆，建立台湾第一个以UHF为主的图书馆自动化系统。钟叶青博士于2007年创立了台湾格网计算学会（该学会于2010年改名为台湾云端计算学会）并担任第一及第二届的理事长。曾带领台湾清华大学的学生团队，赢得2010及2011年在美国举办的学生超算竞赛 (Student Cluster Competition) 冠军。也担任过许多国际会议的大会主席 (General Chair)，议程主席 (Program Chair)，及大会讲者 (keynote Speaker)。也多次获得台湾清华大学的杰出产学研究奖。钟叶青博士回国后，加入深圳清华大学研究院云计算与容灾实验室，担任副主任。 钟叶青博士的研究专长为并行与分布式系统，云计算与大数据平台，及嵌入式系统。他在这些领域发表了近200篇的期刊及会议论文，并开发了许多相关的系统，例如：

  • 2002年研发出全世界第一个GPS汽车导航系统。
  • 2007年研发出台湾第一个高阶模拟架构（HLA）系统。
  • 2010年研发出全世界第一个优化安卓系统的Method-based AOTC编译器，研究成果发表于ACM CASES 2011，2014年谷歌以2000万英镑买下英国一家做类似技术的公司。
  • 2010年研发出全世界第一个并行化的QEMU（PQEMU），研究成果获得IEEE ICPADS 2011最佳论文奖。
  • 2013年研发出台湾第一个大学云系统，是一个以台湾各大学为主体的社群云平台系统，非常适合云计算与大数据的教学及研究使用。
  • 2015年研发出HSAemu 2.0 ，是全世界第一个能够支持 OpenCL 2.0 程序执行的异质系统架构 (HSA) 全系统仿真器，提供了一完整异质系统架构的系统软件堆栈，能协助HSA系统软件及应用程序的开发与验证，研究成果发表于ACM RACS 2016。
  • 2015年研发出全世界第一个HSA虚拟机（HSA-KVM），研究成果获得ACM VEE 2016杰出论文奖。

  研究成果产业化部分，目前在台湾与学生共同成立2家公司：

  • VMFive：主要业务为云端虚拟手机平台（www.vm5.com）。
  • NebulaTek：主要业务为与面向健康照护的云存储及大数据平台 (www.nebulatek.com)

  在技转部分，有如下成果：

  • 云平台NebulaCloud：云核科技
  • 云存储系统NebulaBox：云核科技
  • 融合式大数据库NebulaDB：云核科技，远通电收，大同医护
  • 异质系统仿真器HSAemu：台湾工研院
  • 5G/IoT云平台：台湾资策会

  jbo竞博电竞官方网站广东省计算科学重点实验室 2016年10月31日

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